产业链配套不完善
一是交通基础设施薄弱。巴布亚新几内亚内陆山脉崎岖，陆路交通不发达，省级、城际间公路路况较差，且数量少。巴布亚新几内亚无连接城市间的铁路交通设施，主要城市间交通依靠飞机。另外，由于巴布亚新几内亚三面临海，因此水上运输具有得天独厚的条件。二是巴布亚新几内亚电力供应能力较低。在太平洋地区排名倒数第三，没有全国性的国家电网，只有两个主要电网向莫尔斯比港和莱城、马丹、高地地区供电。全国只有15%的人口能用到电，电力缺口较大。三是矿业设备车辆缺乏。巴布亚新几内亚制造业落后，本土不具备矿业投资所需机械设备和运输车辆的供应能力。
竞争对手云集
巴布亚新几内亚矿业，除了其本土企业外，澳大利亚、南非、韩国等国的矿业企业也已进入，其中包括矿业巨头力拓等。巴厘克、力拓、必和必拓等多家矿产公司已经从巴布亚新几内亚矿产资源局购买了勘探报告。因此，巴布亚新几内亚矿业市场竞争激烈，也会带来一定的市场风险。
商务成本较高
国家治理水平有限
据国际透明组织的一项调查显示，巴布亚新几内亚国内腐败状况始终处于极端腐败的区间，腐败问题是阻碍巴布亚新几内亚中小企业发展的最大障碍。另外，巴布亚新几内亚政府部门协调能力差、政令不畅、工作许可签证难等方面的问题已经成为目前巴布亚新几内亚矿业投资等商业活动的障碍。
社会治安状况较差
近年来巴布亚新几内亚社会治安已经成为社会生活中的突出问题。首都地区和第二大城市莱城为犯罪高发区，持刀(枪)抢劫、偷盗事件时有发生，恶性案件呈上升趋势。而巴布亚新几内亚政府对监狱设施投入不足，近两年多次发生重刑犯越狱事件，巴布亚新几内亚警方警力有限，无法追回全部犯人，使得越狱犯人再次作案，危害社会治安
传染病概率较高
巴布亚新几内亚的主要传染病有疟疾、登革热等，但首都地区发病率较低。全国62%的人员死亡是由肺结核、疟疾及其他传染病造成的;在水传播疾病方面，仅有33%的人口可以喝上干净的水。根据联合国人类发展指数，巴布亚新几内亚仅排名第153位，健康事业一直停滞不前。